Alors que l’empire chinois envoie ses émissaires aux quatre coins du Japon pour y trouver l’enfant qui leur permettra de créer l’élixir d’immortalité, le jeune Kotaro, lui, est contraint de fuir son monastère, ravagé par les flammes. Au hasard de poursuites par les gardes de l’empire, il rencontre Nanashi, un ronin errant de l’ancien domaine d’Owatari, qui se voit contraint de l’aider, bien malgré lui. C’est là que commence le périple de la lutte pour la survie de nos deux héros contre l’empire chinois qui lâche ses sbires contre Kotaro, le probable enfant de la légende.
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